De mosselvisserij vangt mosselzaad en laat dit op mosselpercelen uitgroeien. Wanneer de mosselen groot genoeg zijn, worden ze van de percelen opgevist en naar de Oosterschelde vervoerd. In de Oosterschelde kan de mossel al het zand wegpompen. Dan is het een Zeeuwse mossel geworden. Is de mossel schoon, dan wordt het schelpdier voor de laatste maal opgevist. Zo komt per jaar meer dan 50 miljoen kilo mosselen op de markt. In 1995 bestonden in Nederland 94 mosselkweekbedrijven. In de Waddenzee ligt circa 3100 hectare aan mosselpercelen.

Garnalen worden langs de Noordzeekust en in de Waddenzee gevangen. De meeste worden aan boord gekookt, aan land ingevroren, naar Marokko vervoerd, daar in grote fabrieken ontdooid en door vrouwen gepeld, dan weer ingevroren, teruggetransporteerd en in de handel gebracht. Het gaat per jaar om circa 15 miljoen kilo. De garnalenvisserij in de Waddenzee nam toe in omvang toen de vissers minder kabeljauw in de Nederlandse kustwateren konden vangen en overschakelden op de garnalenvangst. Van de op de visafslagen aangevoerde garnalen is ruim de helft afkomstig uit de Waddenzee.

Tegenwoordig wordt op de Waddenzee alleen op dieren gevist. Vroeger was er ook visserij op zeegras. Het was goed om dijken mee te maken. Het werd gebruikt als stopmiddel tegen lekkende scheepsrompen en als vulmiddel voor matrassen en kussens. In die tijd maaide men de zeegrasvelden. Het drijvende losse zeegras werd opgevist. Deze visserij werd wiervissen genoemd. Met het verdwijnen van de zeegrasvelden verdween ook deze visserij.
Ook de visserij op ansjovis en wulken bracht vroeger geld in het laatje, en men ving tot in de jaren dertig van de vorige eeuw veel roggen in de wadgeulen. Deze soorten zijn echter grotendeels uit de Waddenzee verdwenen, door oorzaken die bij de desbetreffende diersoorten worden besproken.

Hengelen in de kustwateren is populair. Veel visliefhebbers gaan een dagje mee op een kotter of staan langs het water naar hun dobber te turen. In het waddengebied bestaat de vangst vooral uit bot. Hoewel de hengelsport een bezigheid is voor amateurs, wordt er toch veel geld aan verdiend. De omzet van verkopers van wadpieren als aas is jaarlijks meer dan tien miljoen euro. Voormalige vissers verdienen hun brood aan hengelsporters doordat ze hun boot ter beschikking stellen voor een dagje vissen op de Waddenzee of de Noordzee. De jaaromzet van deze branche ligt tussen 7 tot 18 miljoen euro. Vanuit Den Oever en Harlingen vertrekken de meeste waddenvissers.