Die Weibchen der Gemeinen Seehunde können ab ihrem vierten Lebensjahr Nachwuchs bekommen, die Männchen sind erst ab dem sechsten Lebensjahr zeugungsfähig. Die Paarungszeit der Seehunde geht von Anfang August bis Mitte September. Die Trächtigkeit dauert elf Monate, davon findet in den ersten Monaten die sogenannte ‚Keimruhe‘ statt. Das befruchtete Ei nistet sich erst nach drei Monaten in der Gebärmutter ein und beginnt dann zu wachsen. Eigentlich beträgt die Trächtigkeit der Seehunde somit nur 7 Monate.
Ab Mitte Mai werden bei Niedrigwasser die Jungen auf den trocken gefallenden Platen geboren. Sie müssen fast sofort, sobald die Flut aufkommt, schwimmen können. Noch drei Wochen nach der Geburt trinkt das Junge Milch bei der Mutter. In dieser Zeit steigt das Gewicht der Seehundjungen von 10 auf 24 Kilogramm. Das geht deswegen so schnell, weil die Muttermilch sehr nährreich ist, mit einem Fettgehalt von 45%. Zum Säugen begibt sich die Seehundmutter mit ihrem Jungen bei Niedrigwasser auf eine Sandbank. Genau zu der Zeit, wenn die Jungen bei ihrer Mutter säugen, sind auch Freizeitschiffer und Wattwanderer sehr aktiv. Darum wurden im Wattenmeer spezielle Ruhegebiete ausgewiesen, in die während der Geburts- und Säugezeit der Seehunde keine Menschen kommen dürfen. So können die Jungen genug Milch trinken und ohne Störung groß werden. Nach der Säugezeit geht die Mutter wieder ihre eigenen Wege und die Jungen müssen sich selber versorgen. Dann müssen sie ihre eigene Nahrung suchen und erst dann lernen sie, für sich selber Fische zu fangen und zu fressen.

Seehunde fressen vor allem das, was da ist, aber jeder Seehund scheint auch eine eigene Vorliebe für bestimmte Fischarten zu haben. Dadurch ist die Variationsbreite ziemlich groß und sie haben in jeder Saison wieder andere Fischarten auf der Karte stehen. Seehunde fressen am liebsten Fische, die dicht am Boden leben, wie Plattfische, Kabeljauartige, Grundeln und Sandaale. Erwachsene Seehunde, die sich von Plattfischen ernähren, brauchten von diesen bis zu 8 Kilogramm pro Tag. Tiere in Gefangenschaft fressen durchschnittlich nur 3 bis 4 Kilogramm Makrelen oder Hering pro Tag, da diese Fische viel fetter sind.

Seefahrer sehen Seehunde meistens in Gruppen an der Küste oder liegend auf Sandplaten im Wattenmeer. Darum dachte jeder, dass sie auch vor allem in der Nähe der Küste und der Sandplaten lebten. Aber als einige Seehunde einen Sender bekamen, wurde klar, dass die Seehunde ein sehr großes Gebiet nutzen und dass sie nicht nur in der Nähe ihrer Ruheplätze leben.
IMARES arbeitet in den Niederlanden an Studien mit den mit Sendern ausgestatteten Seehunden. Die erste Gruppe von neun Seehunden wurde 1997 mit Sendern auf dem Kopf ausgestattet. Es waren Seehunde, die in Gefangenschaft geboren worden waren. Sie wurden im Brielse Gat ausgesetzt, im südholländischen Deltagebiet. Durch die Sender erhielten die Forscher Informationen über das Verhalten der Seehunde: wo gehen sie auf Jagd, wo sind ihre bevorzugten Ruheplätze, wandern die Tiere über große Abstände und wenn ja, wohin?
Heute werden nur noch wilde Seehunde mit Sendern ausgestattet. Die Forscher möchten so mehr über die Gebiete lernen, die für Seehunde wichtig sind und ob die Seehunde Probleme durch menschliche Aktivitäten haben, wie Schießübungen oder Rammarbeiten. Studien haben gezeigt, dass die kleinen Sender und Antennen die Tiere nicht stören. Die Sender sind am Fell des Seehundes festgeklebt. Wenn der Seehund sein Fell wechselt, fallen sie von selber ab. Die Sender sind im Laufe der Jahre immer kleiner geworden und sitzen jetzt im Nacken statt auf dem Kopf.

1988 und 2002 wurden die Seehunde in der Nordsee und im Wattenmeer von einem Virus infiziert. Beide Male starben mehr als die Hälfte der Gemeinen Seehunde im Wattenmeer. Obwohl die Seehundviren für Menschen nicht gefährlich sind, ist es immer schlau, sich von einem kranken oder toten Seehund fern zu halten. Tote Tiere können neben Viren auch andere Krankheitserreger in sich tragen, die die Gesundheit schädigen können. Zudem sind einige Krankheiten, die Seehunde haben können, auch ansteckend für Hunde.