Het zeeaquarium van Ecomare is ondergronds gebouwd. Wanneer je de trap afdaalt, daal je als het ware onder de zeespiegel. In de grote open aquaria leven tientallen soorten vissen, zeesterren, schaal- en schelpdieren. Per aquarium is een leefgebied nagebouwd. Zo zie je dat er in de Waddenzee veel jonge vissen leven, in de Noordzee juist de grotere exemplaren en in de haven harders en zeebaarzen zwemmen.